福建行都指挥使司， 明朝 五个行都指挥使司之一。

　　洪武四年(1371年)正月在建宁府置建宁都卫。 洪武八年(1375年)十月改为福建行都指挥使司。东南距福建承宣布政使司驻地福州府五百二十五里，属于前军都督府。

　　下辖卫所

　　建宁左卫

　　建宁右卫

　　建阳卫 革

　　延平卫

　　邵武卫

　　汀州卫

　　将乐千户所

　　以下添设：

　　武平千户所

　　永安千户所

　　上杭千户所

　　浦城千户所