东突厥斯坦共和国是指在三区革命中，维吾尔人、哈萨克人在新疆省北部建立的一个独立政权，没有得到其它任何国家承认。

　　1944年8月，巩哈县(今尼勒克县)牧民发动民族起义，占领巩哈县城。1944年11月12日，在苏联支持下成立东突厥斯坦共和国临时政府，17人担任临时政府委员，艾力汗·吐烈为政府主席。1945年，因中苏之间暂时和解与整体国家目标、二战情势，苏联承诺不再介入新疆事务。1946年6月，“东突厥斯坦共和国临时政府”改组为伊犁专区参议会，“东突厥斯坦共和国”宣告终结。

　　行政区划：

　　设有以下四区：

　　塔城区，行政长：巴斯巴伊;下辖：沙湾县、乌苏县

　　迪化区，下辖：绥来县、呼图壁县

　　阿山区，行政长： 乌斯曼;下辖：承化县、福海县、富蕴县、青海县、哈巴河县、布尔津县，并另设哈达子公署[8]

　　莎车区，下辖：蒲犁县

　　伊犁区，行政专员：阿西姆台吉

　　总人口数约在47万人

　　政府架构：

　　东突厥斯坦共和国设有主席，与副主席为共和国正副领导人，并设有秘书长、与委员;委员设有十七人。

　　政府机关设有军政部、宣传部、宗教部、、农林部、教育部、外交部、司法部、财政部、内政部与回族委员会;各部设有部长，回族委员会设委员长。[8]

　　回族委员会另有七名委员。

　　税捐金融：

　　东突厥斯坦共和国成立伊犁银行，并设有干事一人。

　　塔城区设有征收处与税务局，阿山区设有税局。

　　东突厥斯坦共和国民族军：

　　设有参谋本部，参谋总长是拉合木江。

　　东突厥斯坦共和国民族军是由反政府游击队所组成，共分为七个团：绥定第一步兵团、伊宁第二步兵团、伊宁第四预备步兵团、特克斯第一骑兵团、特克斯第二骑兵团、特克斯第三骑兵团(列斯坎)、特克斯第四骑兵团;另有四个独立营：回族独立骑兵营、 蒙古 独立骑兵营、迫击炮独立营、警备独立营;与乌苏独立连。东突厥斯坦共和国民族军人数约在1万2千至1万8千人。东突建国后又将7个团的兵力迅速扩充为13个团。

　　共和国并设有军政部，详细分工不详。

　　与国民政府交战的游击队(民族军)：阿巴索夫游击队(阿不都克里木·阿巴索夫)、阿山游击队(乌斯满·巴图尔)、达列力汗游击队(达列力汗·苏古尔巴也夫)、巩哈游击队(法提哈.穆苏里莫夫)、蒲犁游击队(伊斯哈克伯克·穆努诺夫，约3千人)、吉木乃热马赞游击队(热马赞)、吉木乃游击队(毛拉·伊斯拉姆·伊斯马伊尔，约1千人)、马伊里山游击队(郭文明)、哈萨克游击队(沙湾县哈力拜克)、尼勒克游击队(1944年)、和丰游击队。伊斯哈克别克骑兵旅(苏联中亚人组成，或称斯喀乌伯军)(部分游击队国军无法辨识)

　　旗帜：

　　东突厥斯坦共和国所使用的旗帜有两种，一种是绿底上绘有白色星月标志，一种是用金粉写着“万物非主，唯有真主。穆罕默德是真主的使者”。