六国统一后，遭到商鞅强烈反对的各派学校和人才纷纷来秦任职。也许是秦始皇采取了“有秦特色的商鞅变法”，导致了秦帝国各种迷信的盛行。其中，黄老道士家和阴阳家融合了儒、法、道三家的理论，提出了“五德始于终”的主张，尤其受到秦始皇的信任。秦始皇当时认为秦是水和周的美德。

同时，他们还说海上有蓬莱、方丈和瀛洲诸岛，是神仙居住的地方。他们有“长生不老药”，服用后可以“长生不老”。秦始皇非常想梦想成为一个不朽的人。二十八年，齐垂福写了一封关于海上仙境的信，于是秦始皇派他去招募成千上万的男女老少下海寻仙。

从28年到31年(219 ~ 215年前)，秦始皇不断地巡视东海岸、江淮流域和北方，每到一处，他都刻上石头来赞美自己的功德。

三十二年，秦始皇令盛讨要仙迹如羡门和高誓。后来，韩通、侯功和史圣乞求长生不老药。一些儒家学者也就此行为向秦始皇提出了建议。齐淳于越博士建议，秦始皇仍应实行将子孙封为王的政策。秦始皇把它们交给臣下讨论，李斯丞相反对。

李斯的深思熟虑导致秦始皇下令焚烧书籍并禁止它们，规定所有的历史书都应在没有秦朝的情况下焚烧；如果你不是一名博士生，你敢把那些藏在世界上的诗、书和100本《论坛报》藏起来。那些敢于说“诗”和“书”的人将放弃市场。

那些从未生活在过去的家庭；看见并且知道不举起的官员犯有同样的罪行；如果你不烧它三十天，它将是一个城市旦；准保存者、医学占卜书和植树；如果你想学习法律，你应该向官员学习。

这时，徐福下海去寻仙，这花了他很多钱，但他不能吃药。先帝觉得自己被骗了，于是他下令御史案去问朱升，揭发了460多人的相互牵连，并下令将他们活埋在咸阳。这就是著名的“坑儒”。

有人认为《史记》记载秦始皇是个术士，不是儒生。然而，根据《秦始皇列传》记载，被秦始皇杀害的人“都是背诵孔子的”。

统一七年后，秦始皇开始在渭河南岸修建阿房宫(又称朝宫和阿房宫为其正殿)，每年雇佣70多万民工，而当时全国人口只有2000万。

阿房宫可以容纳10万人，里面需要汽车和马匹来运送食物和酒。只有一个前厅，从东到西长693米，从北到南宽116米，高11.65米，可容纳1万人。

然而，由中国社会科学院考古研究所和Xi文安文物保护考古研究所组成的阿房宫考古队对阿房宫遗址进行了考古工作，发现阿房宫根本没有修建，这座宫殿只是在秦朝完成了奠基。